• Connaitre les principaux serveurs dédiés à l’analyse des génomes
• Apprendre à utiliser des bases de données pour intégrer des données massives et hétérogènes
• Initiation au travail d’équipe
• Comprendre le principe et savoir utiliser des outils bio-informatiques dédiés à l’analyse de séquences
• Apprendre à construire une chaine de traitement efficace
• Utiliser une sélection de langages de programmation utilisés en bioinformatique (Python, Bash)
Contenu
COURS MAGISTRAUX ( 12 H)
Initiation à l'algorithmie à travers les points suivants : • Constantes et variables • Instructions élémentaires • Expressions et opérateurs • Structures de contrôle • Fonctions et procédures • Tableaux et tableaux associatifs • Pointeurs • Gestion des fichiers Introduction au langage de programmation Python
TRAVAUX PRATIQUES ( 39 H)
• Pratique du langage de programmation Python (32 h de TP) • variables, structures de contrôles, … • développement et test de programmes • Projet Individuel (6h de suivi) • le même projet sera réalisé par chaque étudiant • Le projet est à rendre sous la forme d'un programme Python bien commenté
• Connaitre les principaux serveurs dédiés à l’analyse des génomes
• Apprendre à utiliser des bases de données pour intégrer des données massives et hétérogènes
• Initiation au travail d’équipe
• Comprendre le principe et savoir utiliser des outils bio-informatiques dédiés à l’analyse de séquences
• Apprendre à construire une chaine de traitement efficace
• Utiliser une sélection de langages de programmation utilisés en bioinformatique (Python, Bash)
