L’objectif de ce cours est de découvrir les mécanismes influençant l’organisation du génome. En effet, la structure du génome n’est pas figée mais « dynamique ». Elle s’est peu à peu organisée/structurée au cours de l’évolution des espèces. Les mécanismes participant à la stabilité mais aussi son instabilité seront abordés avec une attention particulière pour :
• la réparation des dommages de l’ADN et notamment des cassures double-brin. Les dommages de l’ADN peuvent être à la fois source d’instabilité génétique à l’origine du vieillissement, de nombreux cancers et autres désordres génétiques, mais également source de diversité génétique comme lors de la méiose.
• l’influence des éléments génétiques mobiles (les éléments transposables) sur les réarrangements des génomes au cours de la vie d’un organisme ou à une échelle évolutive plus longue lors de l’émergence des espèces.
L’objectif de ce cours est d’illustrer ces mécanismes tout en découvrant de nouvelles méthodes d’analyses et les différents modèles génétiques qui ont contribués à ces découvertes notamment via l’analyse d’articles de recherche avec des spécialistes du domaine.
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COURS MAGISTRAUX (15 H) La structure des génomes est complexe et s’est façonnée au cours de l’évolution des espèces. L’objectif de ce cours est d’illustrer certains des mécanismes influençant fortement l’organisation du génome eucaryote. Les exemples traités en cours feront appel à différents organismes modèles eucaryotes (champignons, végétaux ou animaux). Le cours décrira :
• les mécanismes de réparation des dommages de l’ADN avec une attention particulière pour la réparation des cassures double-brin (CDB). Les CDB de l’ADN sont des lésions extrêmement toxiques qui peuvent être produites accidentellement (stress environnementaux, réplication) ou physiologiquement programmées par la cellule (méiose, recombinaison V(D)J). Les mécanismes de réparation des CDB sont donc finement régulés pour permettre à la fois de maintenir la stabilité des génomes tout en générant de la diversité génétique. Les applications en biologie moléculaire et en médecine seront également abordées.
• les éléments transposables en retraçant l’historique de leur découverte, leur classification, leur mécanisme de transposition et leur régulation/dérégulation. Les éléments transposables ont très largement contribué aux réarrangements des génomes eucaryotes. Ils seraient à l’origine des rétrovirus et de certaines maladies génétiques notamment chez l’homme. De leur étude découle de nombreuses découvertes originales et l’émergence d’outils de biologie moléculaire appliqués à la transgénèse ou la mutagenèse.
TRAVAUX DIRIGES (15 H) Les TD seront organisés sous forme de présentation d’articles scientifiques. Dans un premier temps, chaque binôme d’étudiant préparera un article scientifique avec un enseignant ou un chercheur puis présentera et commentera avec le reste du groupe les résultats décrits dans l’article lors d’une séance de TD. L’accent sera mis sur la qualité des présentations et sur la compréhension de la démarche scientifique. À l’issue de la présentation de l’article scientifique chaque binôme d’étudiant rédigera un résumé d'un maximum de 2 pages (times 11, interligne 1,5 ; références comprises) en utilisant le gestionnaire de bibliographie de son choix (Zotero, Mendeley, ...). Une séance sera dédiée à l’analyse de ce travail.
Additional Information
L’objectif de ce cours est de découvrir les mécanismes influençant l’organisation du génome. En effet, la structure du génome n’est pas figée mais « dynamique ». Elle s’est peu à peu organisée/structurée au cours de l’évolution des espèces. Les mécanismes participant à la stabilité mais aussi son instabilité seront abordés avec une attention particulière pour :
• la réparation des dommages de l’ADN et notamment des cassures double-brin. Les dommages de l’ADN peuvent être à la fois source d’instabilité génétique à l’origine du vieillissement, de nombreux cancers et autres désordres génétiques, mais également source de diversité génétique comme lors de la méiose.
• l’influence des éléments génétiques mobiles (les éléments transposables) sur les réarrangements des génomes au cours de la vie d’un organisme ou à une échelle évolutive plus longue lors de l’émergence des espèces.
L’objectif de ce cours est d’illustrer ces mécanismes tout en découvrant de nouvelles méthodes d’analyses et les différents modèles génétiques qui ont contribués à ces découvertes notamment via l’analyse d’articles de recherche avec des spécialistes du domaine.
