Contenu
Cours magistraux :
Vecteurs de clonages (Plasmides, BAC et YAC)
Technique de séquençage par la méthode de Sanger,
PCR et Stratégies de PCR, RT-PCR, PCR quantitative.
Hybridation moléculaire
Principes de la cartographie génétique. Introduction aux différents marqueurs moléculaires
Construction et exploitation d’une carte génétique : Construire et exploiter une carte physique ; relation carte physique et carte génétique.
Notions de génétique multifactorielle : introduction aux QTL, à la génétique d’association et à la sélection génomique
Le génotypage de l’ADN à haut débit
Diagnostic du cancer du sein
La sélection génomique chez les plantes d’intérêt agronomique
Travaux Dirigés
Clonage, séquençage selon Sanger
Hybridation (southern blot, northern blot)
PCR (RAPD, RFLP, AFLP, ARMS-PCR)
Interprétation de ségrégations de simples à plus complexes (faisant intervenir des interactions entre les gènes)
Utilisation du Chi2
Analyse de ségrégations impliquant des mutations létales
Analyse des grandes distances en génétique
Evaluation de l’interférence des crossing-over
Cartographie à l’aide de marqueurs moléculaires.
Travaux pratiques
Analyses moléculaires sur des lignées de cellules humaines et chez Arabidopsis thaliana.
Réalisation d’une approche de cartographie génétique sur des lignées recombinantes (RIL) chez Arabidopsis thaliana.
Analyses/outils Bio-informatique (design d’amorces, PCR et clonage in silico)
Les techniques utilisées feront appel à :
Extraction d’ADNg, dosage, PCR, Analyse sur gel
Digestions enzymatiques Southern blot, Transfert, marquage de sondes, hybridation. RT PCR.
Analyse de la cartographie génétique et analyse de liaison
Utilisation du logiciel de cartographie Mapdisto (http://mapdisto.free.fr/).
