Intestinal Microbiota, Nutrition, Immunity

Basic courses (Bachelor's level) in microbiology and cell biology. S1 lecture: Intestinal Microbiota, digestive system and pathologies. L’étudiant devra avoir suivi des enseignements de base (niveau Licence) en microbiologie et biologie cellulaire, et le module Microbiote Intestinal, Environnement digestif et Pathologies du S1.

Acquire deep knowledge of the relationships between the intestinal microbiota, the immune system, nutrition and diseases in humans; understand the design of innovative therapeutic approaches. Poursuivre l’acquisition des connaissances indispensables à la compréhension des liens entre microbiote intestinal et pathologies, et à la conception d’approches thérapeutiques innovantes. Connaître et maîtriser les stratégies scientifiques et les techniques mises en œuvre pour analyser les liens entre microbiote intestinal, immunité, nutrition et pathologies, ainsi que les mécanismes d’action des probiotiques/prébiotiques.

Courses will include (i) lectures exploring the gut microbiome:
- Relationship between intestinal microbiota and diseases,
- Design of innovative therapies,
(ii) Tutorials to illustrate the course by analyzing recent scientific papers.

Cours magistraux
The lectures will explore some of the following themes (depending on recent scientific papers and clinical news):
Relationship between intestinal microbiota and diseases:
- Microbiota and Muscle Function;
- Microbiota and Obesity / Metabolic diseases;
- Chronic inflammatory bowel disease (IBD) and dysbiosis;
- Microbiota and Colorectal Cancer;
- Microbiota and visceral sensitivity, Irritable Bowel Syndrome (IBS) / Functional bowel disorders;
- Microbiota in the Gut Brain axis;
- Microbiota and Allergies (immunological mechanisms of allergy, microbiota-allergies link,
oral immunotherapy / food allergy, prevention of allergies with probiotics)
- Microbiota and Respiratory Function (Gut Lung axis);
- Microbiota and aging.
Design of innovative therapies:
- Mechanisms of action of Probiotics / Prebiotics; regulatory aspects
- Pathologies and fecal transplantation
- Use of recombinant microorganisms in the digestive tract


L’enseignement comportera (i) une partie théorique permettant de poursuivre l’acquisition des connaissances indispensables à la compréhension :
- des liens entre microbiote intestinal et pathologies,
- des mécanismes liés à la conception de thérapeutiques innovantes,
(ii) des enseignements dirigés permettant d’illustrer le cours de façon concrète par l’analyse de publications récentes.
Les cours magistraux et les TD permettront de développer certains des thèmes suivants (en fonction des publications récentes et de l’actualité scientifique et clinique) :
Liens entre microbiote intestinal et pathologies :
- Microbiote et Fonction musculaire ;
- Microbiote et Obésité / Maladies métaboliques ;
- Maladies inflammatoires Chroniques de l’Intestin (MICI) et dysbiose ;
- Microbiote et Cancer Colorectal ;
- Microbiote et sensibilité viscérale, Syndrome de l’Intestin Irritable (SII) /Troubles fonctionnels intestinaux (TFI) ;
- Microbiote et Cerveau (Gut Brain axis) ;
- Microbiote et Allergies (mécanismes immunologiques de l'allergie, lien microbiote-allergies,
immunothérapie orale/allergie alimentaire, prévention des allergies par les probiotiques)
- Microbiote et Fonction Respiratoire (Gut Lung axis) ;
- Microbiote et vieillissement.
Conception de thérapeutiques innovantes :
- Mécanismes d’action des Probiotiques / Prébiotiques ; aspects réglementaires
- Pathologies et transplantation fécale
- Utilisation de microorganismes recombinants dans l’écosystème digestif

Travaux Dirigés
The tutorials will illustrate and deepen the theoretical course with applications chosen from recent scientific papers. Train students to scientific analysis: know how to interpret, exploit and criticize results; learn how to present them.
Les travaux dirigés permettront d’illustrer et d’approfondir le cours théorique à l’aide d’applications concrètes choisies dans des publications récentes, et de former les étudiants à la réflexion scientifique par l’étude des stratégies de recherche et des approches expérimentales.

Acquire deep knowledge of the relationships between the intestinal microbiota, the immune system, nutrition and diseases in humans; understand the design of innovative therapeutic approaches. Poursuivre l’acquisition des connaissances indispensables à la compréhension des liens entre microbiote intestinal et pathologies, et à la conception d’approches thérapeutiques innovantes. Connaître et maîtriser les stratégies scientifiques et les techniques mises en œuvre pour analyser les liens entre microbiote intestinal, immunité, nutrition et pathologies, ainsi que les mécanismes d’action des probiotiques/prébiotiques.