Métabolismes microbiens: diversité et rôles

Maîtriser les techniques et concepts de base de microbiologie (manipulations stériles, ensemencement de milieux,…)

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Cours magistraux
- Ecologie microbienne : Métabolismes bactériens, les bactéries photosynthétiques. La chimiolithotrophie. La vie sans oxygène. La dégradation des composés complexes.
- Structure et évolution des génomes microbiens : Structure du chromosome bactérien. Eléments extra-chromosomiques et compétence bactérienne. Relation entre métabolisme et plasticité génomique. Relation avec l’identification bactérienne.
Travaux Dirigés
Préparation aux TPs :
- Métabolismes bactériens : exemple de la colonne de Winogradsky (1.5 h)
- Transformation bactérienne : exemple de modification génétique (1.5 h)
Travaux pratiques
- Métabolismes bactériens : Isolement de micro-organismes métaboliquement différents présents dans la colonne de Winogradsky : Photosynthèse, respiration, sulfato-réduction, méthanogénèse… et identification moléculaire.
- Production d’une protéine fluorescente en système hétérologue bactérien.

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