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Cours magistraux
- Description du réseau trophique microbien d’eau douce
- Qualité des eaux :
Origine, description et identifications des microorganismes pathogènes, technique d’épuration des eaux usées, contrôle qualité et indicateurs de qualité.
Algues toxiques en milieu marin et eau douce. Réseaux de surveillance.
- Microorganismes et cycles biogéochimiques dans les milieux aquatiques :
Rôle des microorganismes dans les grands cycles biogéochimiques aussi bien dans la colonne d’eau que dans les sédiments, en conditions aérobie et anaérobie.
Cycle de la matière organique et son importance dans le fonctionnement des réseaux trophiques aquatique (minéralisation, fermentation…)
Cycle de l’azote : rôle des Archaea dans l’oxydation de l’ammonium
Cycle du chlore : rôle des microorganismes déhalorespirants dans le fonctionnement des milieux aquatiques
- Plasticité métabolique des microorganismes eucaryotes et impacts sur le fonctionnement du réseau trophique aquatique
- Plastisphère et communautés microbiennes.
Travaux Dirigés
- Construction d’un réseau trophique aquatique
- Approches et méthodes permettant de mettre en évidence des microorganismes mixotrophes (travail en groupe)
- Etudes de publications sur les risques écologiques et sanitaires en lien avec la réutilisation des eaux usées en agriculture
- Etude de la dégradation de composés naturels chlorés par des bactéries spécialisées
- Reconstitution du cycle de la MO en zone pélagique : processus biotiques et abiotiques impliqués dans les échanges POM-DOM
- Les microorganismes impliqués dans l’oxydation de l’ammonium : paramètres influençant les archées et bactéries ammonio-oxydantes.
