L'actualité scientifique de l'ISVSAE

En combinant deux génomes dans un seul noyau, les plantes hybrides nouvellement formées doivent rapidement s’adapter pour stabiliser leur méiose (la division cellulaire essentielle à la reproduction sexuée), et rétablir leur fertilité. Dans une étude publiée dans le journal New Phytologist, les scientifiques ont mis en évidence, chez les plantes néosynthétisées d’Arabidopsis suecica, des associations chromosomiques anormales entre les deux génomes pendant la méiose, associées à une réduction drastique de leur fertilité.

Escherichia coli O157:H7 est un pathogène alimentaire appartenant au tristement célèbre STEC/EHEC responsable de SHU pédiatrique encore récemment impliqué dans des intoxications alimentaires [1] ou faisant l’objet régulier de rappels de produits, en particuliers fromages à pâtes molles et viandes hachées [2]. Ces matrices alimentaires structurées présentent une hétérogénéité liée à des microenvironnements abritant de multiples micro-gradients qui peuvent évoluer avec le temps et l'activité microbienne. En se focalisant sur l’acidification du milieu, nous avons étudié l’expression du gène gadB codant une glutamate décarboxylase impliquée dans la tolérance d'Escherichia coli au stress acide.

Dans le cadre d’une collaboration avec The Institute for Molecular Science, La Trobe University (Australie) et l’UMR MEDIS, une nouvelle structure de protéase bactérienne appartenant à la famille des SATs (subtilase autotransporters) a été publiée dans le journal Nature Communications, ce travail contribuant à une meilleure compréhension du rôle des protéases bactériennes dans le tractus gastro-intestinal animal, humain ou d’autres écosystèmes de la chaîne alimentaire.

Notre étude publiée dans The Plant Cell suggère que KAKU4, une protéine du nucléosquelette/lamina des plantes, partage un ancêtre commun avec les nucléoporines NUP82 et NUP136 et participe à la constitution d’un réseau protéique médié par de courts motifs peptidiques reliant le nucléosquelette et le panier du pore nucléaire. Ce travail a été réalisé par l’équipe d’Aline Probst et Christophe Tatout au iGReD de Clermont-Ferrand en collaboration avec Pierre Tuffery (Université Paris-Cité), Kentaro Tamura (Université de Shizuoka, Japon) et Célia Baroux (Université de Zürich, Suisse).

De nombreux polluants organiques persistants (POPs) s’accumulent dans notre environnement. Les travaux publiés par l’équipe NuReP de l’iGReD dans la revue « Oncogene » montrent que l’exposition à des concentrations faibles de certains de ces POPs augmentent le risque de développement d’une forme agressive du cancer de la prostate. Ces travaux sont le fruit d’une collaboration internationale entre des équipes de recherche françaises de Clermont-Ferrand (iGReD, Centre de Lutte contre le Cancer Jean Perrin, CHU) et de Nice (C3M, IPMC), norvégienne (IBMS, Oslo) et américaines (Baylor College of Medicine, VA Medical Center, Houston TX).

Les douleurs abdominales chroniques, un symptôme partagé par de nombreux patients atteints de pathologies gastro-intestinales comme le Syndrome de l’Intestin Irritable (SII) ou les Maladies Inflammatoires Chroniques de l’Intestin (MICI), représentent un motif de consultation récurrent en gastroentérologie et pour lesquels les traitements sont limités et souvent peu efficaces. Dans ce contexte, la recherche de nouvelles stratégies thérapeutiques constitue une priorité. Le rôle potentiel du microbiote intestinal dans la modulation de la douleur suscite un intérêt croissant depuis quelques années. L’exploration des propriétés neuromodulatrices du microbiote intestinal permettrait d'identifier des probiotiques de nouvelle génération en tant que thérapies alternatives pour la gestion de la douleur viscérale.

Effet des concentrations subthérapeutiques et thérapeutiques de sulfaméthazine sur les gènes transcrits et les protéines traduites impliqués dans la résistance et la dégradation de Microbacterium sp. C448

La maladie de Crohn (MC) est une maladie inflammatoire chronique de l’intestin (MICI) qui altère considérablement la qualité de vie des patients. Elle peut entrainer des lésions intestinales progressives qui peuvent nécessiter une résection intestinale. La physiopathologie de la MC est encore mal connue mais le rôle des Escherichia coli adhérents et invasifs (AIEC) a été mis en évidence bien que leur contribution dans la genèse et l’évolution de la maladie ne soit pas élucidé. Les résultats de l’étude clinique (en lien avec le groupe national REMIND) ont montré que la présence d’AIEC au moment de la résection chirurgicale ou dans les 6 mois après la chirurgie semblent être un facteur de risque de récidive post-opératoire. L’éradication de ces bactéries représentent donc un enjeu majeur dans la prise en charge de la MC.

Cymbopogon schoenanthus (L.) Spreng ou herbe à chameau est une plante herbacée des régions désertiques. Elle est endémique du Burkina Faso et utilisée par les tradipraticiens dans différentes pathologies associées à des dérèglements inflammatoires. La biodiversité présente au Burkina Faso permet la conservation de plantes dont les huiles essentielles n’ont pas encore révélé tous leurs secrets. Ce point est d’autant plus important que les pays de la région sub-saharienne n’ont pas accès à la pharmacopée occidentale ciblant spécifiquement la pathologie tumorale, essentiellement pour des questions économiques. En collaboration avec l’équipe animée par le Dr. Bagora BAYALA à l’Université de Ouadagoudou et l’Université de Koudougou, nous avons pu caractériser les effets de l’huile essentielle de Cymbopogon schoenanthus (L.) Spreng sur des cellules tumorales en culture. Ces travaux publiés par Molecules ouvrent de nouvelles perspectives pour le développement de molécules utilisables en pathologies tumorales et four

La réponse immunitaire anti-infectieuse doit être étudiée dans des modèles biologiques pertinents permettant de l’appréhender dans sa globalité. L’avènement de techniques innovantes d’imagerie intravitale a joué́ un rôle déterminant dans les études, au sein d’un tissu donné et en temps réel, de la dynamique de la fonction des cellules immunitaires (approche de microscopie confocale, souris transgéniques possédant des cellules immunitaires fluorescentes).

Un laboratoire dédié à l’analyse de l’ADN ancien– technique scientifique appelée paléogénomique, a vu le jour sur le site des Cézeaux d’INRAE Clermont-Auvergne-Rhône-Alpes, et a été inauguré le 24 mars en présence des partenaires et financeurs : le PALEOLAB.

Communiqué de presse.

Dans ce travail publié dans le journal Microbiology Spectrum, des scientifiques de l’UMR MEDIS de l’Université Clermont Auvergne en collaboration avec Métagénopolis ont réalisé une étude pilote sur un nouveau modèle in vitro permettant d’étudier le processus d’invasion du microbiote intestinal par le microbiote oral.

L’utilisation à grande échelle de l’antibiotique Colistine a conduit à l'identification du premier gène de résistance plasmidique chez des Escherichia coli en 2015. Ce gène mcr-1 modifie le lipopolysaccharide de la paroi bactérienne, qui est à la fois la cible de la colistine et l’organe senseur des bactéries pour interagir avec l’environnement. Dans ce travail, nous avons explorer l’impact de l’acquisition de ces gènes mcr sur le comportement de E. coli dans l’environnement intestinal et sa virulence. Il émerge des résultats un nouveau paradigme où l’acquisition d’un gène favorise l’implantation et la persistance dans le microbiote intestinal via (i) l’adhésion au mucus et aux cellules épithéliales intestinales, (ii) la résistance aux défensines de l’intestin, et (iii) une activité « peacekeeper » vis-à-vis du système immunitaire.

Communiqué de presse.

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Le cancer de la surrénale est une tumeur agressive, retrouvée plus fréquemment chez les femmes que les hommes. Grâce à des modèles de souris reproduisant une mutation identifiée chez les patients, nous avons montré que ce sont les macrophages, plus actifs dans la surrénale mâle, qui expliquent ce dimorphisme sexuel, par leur capacité à tuer les cellules tumorales. Cette activité anti-tumorale dépend des androgènes et peut être stimulée chez les femelles grâce à la testostérone. Ces travaux publiés par Science Advances ouvrent de nouvelles perspectives thérapeutiques pour ce cancer de mauvais pronostic.

Brève scientifique

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Communiqué de presse - Des scientifiques d’INRAE ont développé une méthode d’imagerie innovante qui permet de suivre la diffusion du sel dans les aliments. Elle pourrait être un levier essentiel pour encourager des pratiques industrielles et domestiques utilisant moins de sel, tout en préservant le goût salé. Ses résultats sont parus dans deux articles le 17 février dans la revue Magnetic Resonance in Chemistry.

En développant des stratégies de génomique fonctionnelle sur des modèles murins, et en collaborationavec un réseau international de chercheurs et cliniciens, une équipe de chercheurs de l’institut GReD àClermont-Ferrand vient d’identifier les différents circuits moléculaires impliqués dans le développementde tumeurs testiculaires de patients atteints d’une maladie rare, le Complexe de Carney. Journal OfClinical Investigations

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Un nouveau modèle de prédiction de l’impact du réchauffement climatique sur les besoins nutritionnels des organismes ectothermes (insectes, zooplancton…).Communiqué de presse - Publication dans Ecology Letters.