Publié le 22 mai 2023 – Mis à jour le 25 mai 2023
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Brève scientifique - Zoom sur un article paru récemment dans la revue scientifique "Atmospheric environment" impliquant notamment plusieurs chercheurs de l'Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF / UCA).

Alors que la présence d'eau condensée dans les nuages ​​pourrait avoir une influence sur la diversité des bactéries circulant dans la haute atmosphère, les aérosols et les nuages ​​ont été relativement peu étudiés en termes de contenu microbiologique. Dans ce travail, nous avons étudié la diversité bactérienne aéroportée recueillie tout au long de l'année sur un site de haute montagne lors de situations météorologiques nuageuses et claires. Des échantillons ont été prélevés à l'aide d'impacteurs à haut débit pour examiner les concentrations totales de cellules et d'ADN, ainsi que la diversité bactérienne par séquençage à haut débit. Dans l'ensemble, une diversité bactérienne très similaire a été observée dans les nuages ​​et l'air clair, avec jusqu'à 73,8 % de la richesse partagée au niveau de la variante de séquence d'amplicon (ASV). La diversité bactérienne était plus variable entre les dates d'échantillonnage en l'absence de nuages ​​en raison d'une gamme plus large de conditions météorologiques, mais au sein des masses d'air individuelles, les situations nuageuses étaient plus hétérogènes en raison des proportions plus élevées de taxons à faible abondance. Certains taxons se sont révélés plus abondants dans les nuages ​​par rapport aux situations claires, comme Staphylococcus, Acinetobacter, Kocuria et Enhydrobacter, ou à l'inverse, comme Bacillus. À l'exception de Kocuria, ceux-ci pourraient tous être expliqués par des facteurs concomitants autres que la présence de nuages, c'est-à-dire la saison et l'altitude de la couche limite atmosphérique. Ce travail souligne que les assemblages bactériens en suspension dans l'air sont régis par de nombreux facteurs environnementaux interconnectés difficilement distinguables les uns des autres. Les prélèvements répliqués permettent de décrypter leurs rôles respectifs, et cette pratique doit être généralisée dans le domaine de l'aérobiologie.

 

La publication s'intitule "Comparative analysis of bacterial diversity in clouds and aerosols"

Auteurs : Raphaëlle Péguilhan, Florent Rossi, Olivier Rué, Muriel Joly, Pierre Amato
Journal : Atmospheric Environment, Volume 298, 2023, 119635,
Lien vers la publication : https://doi.org/10.1016/j.atmosenv.2023.119635
Mots Clef : Bioaérosols ; Nuages ; Atmosphère ; Diversité Bactérienne