Diversité et dynamique fongiques lors de l'immersion à long terme de plastiques conventionnels et biodégradables dans l'environnement marin
Brève scientifique - . En utilisant une approche de métabarcodage ciblant deux marqueurs génétiques, des chercheurs de l'Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF) ont mis en évidence que les communautés fongiques associées aux polymères plastiques étaient distinctes de celles trouvées dans l'eau de mer environnante.
Les déchets plastiques sont associés à une crise mondiale, avec de forts impacts négatifs sur les écosystèmes terrestres et aquatiques. Dans les milieux marins, divers organismes colonisent les débris plastiques, mais peu d'études se sont concentrées sur les communautés fongiques malgré leurs rôles écologiques non négligeables dans le milieu marin. Dans cette étude, différents types de plastiques (biodégradables et conventionnels) immergés dans des milieux naturels marins et dans des environnements contrôlés en laboratoire ont été collectés après une colonisation à long terme.
En utilisant une approche de métabarcodage ciblant deux marqueurs génétiques, à savoir la région ITS2 et la région hypervariable V4 du gène ARNr 18S, les chercheurs ont mis en évidence que les communautés fongiques associées aux polymères plastiques étaient distinctes de celles trouvées dans l'eau de mer environnante. Ils différaient également significativement entre les lieux d'échantillonnage et la nature des polymères immergés, indiquant que la colonisation fongique était impactée par les sites et les types de plastiques, avec de nettes dissemblances entre les polymères conventionnels et biodégradables.
Spécifiquement pour le polymère PVC conventionnel (polychlorure de vinyle), les chercheurs de l'ICCF ont également observé les étapes successives de développement et de maturation du biofilm après une immersion de longue durée dans l'eau de mer. Un changement notable dans les communautés fongiques a été observé environ 30 à 40 jours en milieu naturel, suggérant une dynamique de colonisation probablement associée à une transition de la formation de biofilm à des communautés distinctes probablement associées à l'encrassement biologique. Globalement, cette étude renforce l'idée que le règne fongique fait partie intégrante de la "plastisphère".
- D'après la publication Fungal Diversity and Dynamics during Long-Term Immersion of Conventional and Biodegradable Plastics in the Marine Environment, Journal Diversity, Volume 15 (4), 2023, 1424
- Auteurs : Aurélie Philippe, Cyril Noël , Boris Eyheraguibel, Jean-François Briand , Ika Paul-Pont, Jean-François Ghiglione, Emmanuel Coton and Gaëtan Burgaud
- DOI : https://doi.org/10.3390/d15040579
- Mots clefs : biodegradable vs. conventional plastics